Solutions Bio-informatiques │ script pipeline développement

Bio-informatique

SoftNLabs possède une expertise dans le développement et l’implémentation de solutions bio-informatiques, aidant les sociétés à stocker, traiter, analyser, gérer et retrouver de larges volumes de données nécessaires pour accélérer la recherche dans le domaine des biotechnologies.

Nous pouvons vous aider avec le séquençage de jeux données brutes volumineux et souvent complexes, afin que les données soient analysées plus efficacement.

Nous pouvons vous aider à organiser et stocker correctement vos jeux de données afin que les données soient optimisées et retrouvables facilement dans le futur.

Parmi nos domaines de compétences :

Développement de scripts pour automatiser les tâches répétitives et gérer de grandes quantités de données.

Développement de pipeline, composé d’un large éventail d’algorithmes logiciels pour traiter les données brutes de séquençage. Nous pouvons par exemple créer des pipelines permettant d’analyser et de traduire les données dans un format utilisable.

L’utilisation de langages de programmation tels que :
- Python (un langage de programmation interprété, interactif, orienté objet)
- Bash (un interpréteur en ligne de commande utilisé pour manipuler efficacement les fichiers et répertoires)
- R (un langage de programmation pour le traitement statistique graphique pouvant être utilisé pour nettoyer, analyser et représenter graphiquement les données)

L’utilisation d’environnements de développement intégré (IDE) tels que :
- R studio (R Studio utilise le langage R pour développer des programmes statistiques et graphiques)

L’équipe SoftNLabs connaît les applications telles que Chimera, VMD, etc., utilisées pour simuler les comportements moléculaires dans les systèmes chimiques ou biologiques.